La histología pone de manifiesto una ampolla subepidérmica con formación de microabscesos de neutrófilos papilares y numerosos eosínofilos y fibrina. Los vasos sanguíneos de la dermis superior están rodeados de un infiltrado linfohistiocítico con algunos neutrófilos. Muchas veces, las lesiones son muy difíciles de diferenciar de las de la enfermedad IgA lineal, de la erupción ampollosa del lupus eritematoso, del pénfigo ampolloso o de la epidermólisis ampollosa adquirida.

La dermatitis herpética puede ser confundida con muchas otras enefermedades de la piel debido a sus manifestaciones pleomórficas y a que en la mayoría de los casos las lesiones vesiculosas no se aprecian. Algunas condiciones que deben incluirse en el diagnóstico diferencial son el eritema multiforme, la escabiosis, la dermatosis acantolítica transitoria, la pitiriasis liquenoide y varioliforme y el pénfigo ampolloso.