En la fase inflamatoria de la acrodermatitis crónica atrófica no suele haber cambios en la epìdermis. Ocasionalmente la piel es más fina y muestra degeración. Los hallazgos más característicos son la presencia de teleangiectasias conjuntamente con densos infiltrados de linfocitos y células plasmáticas. A medida que la enfermedas progresa, se observa una degeneración de la elastina y del colágeno, con progresiva degeneración de los folículos pilosos y de las gándulas sebáceas.

No se conoce con exactitud la fisiopatología de esta manifestación, que parece estar asociada a la persistencia de espiroquetas en la piel. Pueden contribuir a la misma varias reacciones inespecíficas unidas a respuestas de tipo inmunológico