Las lesiones faciales de la dermatitis pustular contagiosa se asemejan a varios tumores de piel. En estos casos, se debe practicar una biopsia. También se pueden realizar cultivos de los virus en células de oveja, ensayos de inmunofluorescencia con anticuerpos o estudios de microscoìa electrónica.

Sin embargo, una historia clínica y la evolución de la enfermedad en una persona en contacto con ovejas es suficiente para asegurar el diagnóstico.

Para el diagnóstico diferencial hay que tener en cuenta el granuloma piogénico, el eritema multiforme. el ántrax cutáneo, el carcinoma cutáneo de células basales o escamosas y el melanoma maligno