En un 10-20% de los casos, se presentan múltiples lesiones en la enfermedad de Bowen.

La escisión simple es el método preferido cuando el tamaño y la localización de la lesión lo permiten. Además, esta técnica permite el estudio histológico de la lesión para descartar un posible carcinoma espinocelular. Las curaciones alcanzan el 90-94%

La cirugía micrográfica de Mohs suele ser el método preferido cuando es necesario preservar tejidos por razones estéticas o funcionales.

La electrocoagulación, la criocirugía y el curetaje son también procedimientos efectivos con un porcentaje de éxito del 80 al 97%.

El 5-fluoruracilo al 5% ha sido utilizado con un éxito variable (66-90%). La aplicación del fármaco se lleva a cabo mediante un vendaje oclusivo o por iontoforésis durante una media de 6 a 16 semanas. Las recaídas no son infrecuentes (10%).

Se ha reportado un índice de curaciones del 93% con la aplicación del imiquimod al 5%, 3 veces por semana durante 16 semanas, sin que se observasen recurrencias