La enfermedad de Bowen suele mostrar una cierta predilección hacia la parte inferior de las piernas de las mujeres, aunque cualquier parte del cuerpo puede resultar afectada.

El riesgo de que una lesión de la enfermedad de Bowen evolucione a un carcinoma espinocelular se estima en un 5%. Sin embargo, una vez que se instaurado el carcinoma, se observan metástasis en el 30-35% de los casos.

En general, la prognosis de la enfermedad de Bowen es buena, existiendo numerosas modalidades de tratamiento: escisión simple, cirugía micrográfica de Mohs, electrodisecado, curetaje, criocirugía, terapia fotodinámica y tratamiento tópico con 5-fluoruracilo o imiquimod.