La historia natural de la enfermedad de Lyme se divide en tres estadios a partir de sus manifestaciones clínicas. Se han propuesto para cada uno de estos estadios los términos de infección localizada precoz, infección diseminada precoz e infección tardía o crónica.

La espiroqueta causante de la enfermedad de Lyme fue descubierta en 1981-1982 en unas investigaciones rutinarias realizadas sobre las garrapatas